第一賓館座落於觀音亭北側高地，前身為日治時期的「貴賓館」，1940（昭和15）年興建，1942年10月26日由澎湖廳長大田政作主持上棟祭，1943年2月竣工落成。

1949（民國38）年5月17日，已下野的蔣中正總統首度飛抵澎湖，下榻貴賓館，自此長期成為「蔣公行館」，並改名為「第一賓館」。之後，蔣經國總統、李登輝總統多次蒞澎視察，也以第一賓館為下榻歇腳之處。 

第一賓館因其建築特色與歷史意義，1998年12月10日公告為縣定古蹟。2009年完成建築主體整修工程，2011年5月18日開館，正式開放民眾參觀。 

第一賓館長期作為「蔣公行館」，故其本體空間，以呈顯「蔣公行館」之生活情境、原始使用空間之室內佈設為主題。此外，周遭環境靜謐恬適，在綠蔭扶疏的陪襯下，顯得低調而神秘；其和洋折衷式樣所呈現的豐富建築語彙，以及清空明淨的庭園美學，已成為澎湖日治時期建築的最佳文本和典範。